Les comissions i grups de treball són els principals òrgans de participació dels associats en l'activitat del CSC. En aquests espais, es produeix un intercanvi constant d'informació, coneixement i experiències, i s'elaboren els posicionaments col·lectius amb relació a les diverses àrees d'actuació que s'hi cobreixen. El CSC trasllada aquests posicionaments als centres de decisió de les polítiques sanitàries, d'atenció social i laborals.